Exploring RNA conformational ensembles in silico: progress and challenges

Este capítulo revisa las estrategias computacionales actuales para explorar los ensembles conformacionales del ARN, destacando los desafíos relacionados con la eficiencia de muestreo y la precisión de los campos de fuerza, mientras ilustra su impacto mediante casos de estudio y señala direcciones futuras que integran datos experimentales y aprendizaje automático.

Roeder, K., Stirnemann, G., Meuret, L. + 4 more2026-02-18📄 molecular biology

Embryonic cortical extracellular vesicles confer neuroprotection via multipathway signaling with CaMKIIα as a key mediator

Este estudio demuestra que las vesículas extracelulares pequeñas derivadas de la corteza embrionaria de ratón ejercen efectos neuroprotectores mediante la activación de múltiples vías de señalización, con CaMKIIα como mediador clave, restaurando la estabilidad de los microtúbulos y la respiración mitocondrial en neuronas envejecidas gracias a su carga de BDNF.

Garcia-Rodriguez, R., Gonzalez de la Fuente, S., Guerrero-Valero, M. + 6 more2026-02-18📄 molecular biology

Regulatory landscapes and structural choreography of transcription initiation in spirochetes

Este estudio revela que la ARN polimerasa de las espiroquetas posee una capacidad reducida para fundir promotores, la cual es compensada por la proteína CarD, y describe un mecanismo de desenrollamiento único que implica el desenganche temprano del elemento -35, junto con una unión no específica inusualmente fuerte al ADN que podría estar vinculada a la estructura extendida de su nucleoloide.

Trapp, V. K., Wang, T., Hilal, T. + 8 more2026-02-17📄 molecular biology

Conserved sequence elements in the final exon of MDM2-eight-exon skipping event reveal a cassette regulon model of alternative splicing controlled by a distal regulatory element.

Este estudio demuestra que el salto de ocho exones en el gen MDM2, inducido por estrés genotóxico y regulado por elementos distales en el último exón según un modelo de regulón, genera una isoforma que modula la proliferación celular y confiere protección contra la neoplasia, ofreciendo nuevas perspectivas para terapias contra el cáncer.

Khurshid, S., Montes, M., Rahat, R. + 8 more2026-02-17📄 molecular biology

Aging in Fast-Forward: An Inducible SIRT6 Deficiency model as a Lens on Brain Aging and Neurodegeneration

Los investigadores desarrollaron un modelo celular neuronal reversible y de bajo costo que simula el envejecimiento mediante la depleción gradual de SIRT6, permitiendo identificar firmas transcripcionales clave, distinguir entre cambios fisiológicos y patológicos asociados al Alzheimer, y descubrir vías compartidas como el transporte nucleocitoplasmático alterado.

Rabuah Botton, Y., Smirnov, D., Yang, S. + 7 more2026-02-17📄 molecular biology

Interrogating the Mechanisms of Cas9-mediated Allele Conversion

Este estudio presenta un nuevo sistema de reporte celular (CHACR) para investigar los mecanismos de conversión alélica mediada por Cas9, demostrando que es posible reparar mutaciones heterocigotas utilizando el alelo homólogo como molde y que la eficiencia de este proceso puede mejorarse mediante la inhibición de DNA-PKcs o la sobreexpresión de RAD51.

Murray, J. B., Collins, E., Lonetti, L. + 4 more2026-02-17📄 molecular biology

Greater Expression of DNA Repair Pathways in Sharks vs. Rays/Skates Based on Transcriptomic Analyses

Un análisis transcriptómico reveló que las especies de tiburones presentan una expresión significativamente mayor de cuatro vías principales de reparación de ADN en comparación con las rayas y las mantas, lo que podría conferirles una mayor capacidad para resistir el daño genotóxico en océanos contaminados y evitar el cáncer.

Simmons, C. R., Grant, S. L., Llorente Ruiz, L. + 3 more2026-02-16📄 molecular biology

Antisense oligonucleotide allele-specific targeting of EFEMP1 in a patient-derived model of Doyne honeycomb retinal dystrophy

Los investigadores desarrollaron un oligonucleótido antisentido específico para la alergia que, al dirigirse al transcripto mutado de EFEMP1 en un modelo derivado de pacientes de distrofia retiniana de Doyne, logró eliminar eficazmente las acumulaciones patológicas de lipidos y depósitos extracelulares, demostrando su potencial como terapia viable incluso tras la aparición de los síntomas.

Rezek, F. O., Sanchez-Pintado, B., Eden, E. R. + 6 more2026-02-16📄 molecular biology

Lipid Acyl Chain-Driven α-Synuclein Fibril Polymorphisms and Neuronal Pathologies

Este estudio demuestra que las alteraciones relacionadas con la edad en la composición de las membranas neuronales inducen cambios estructurales específicos en las fibrillas de α-sinucleína que, a su vez, modulan su asociación con la membrana y potencian la patología neuronal, estableciendo así un vínculo directo entre la dinámica de las membranas y la neurodegeneración por amiloides.

Baek, Y., Alim, A., Dong, Y. + 3 more2026-02-16📄 molecular biology

INTERPOLATION-BASED CONDITIONING OF FLOW MATCHING MODELS FOR BIOISOSTERIC LIGAND DESIGN

Este artículo presenta dos estrategias de condicionamiento sin entrenamiento, denominadas Interpolate-Integrate y Replacement Guidance, que permiten adaptar modelos de flujo de emparejamiento 3D para el diseño bioisóstero de ligandos preservando características clave como la forma y los patrones farmacóforos sin necesidad de reentrenamiento costoso.

Ziv, Y., Buttenschoen, M., Scheibelberger, L. + 2 more2026-02-16📄 molecular biology